Гепард бегает с умопомрачительной скоростью. Кошка мгновенно залезает на высокое дерево. Хамелеон камуфлирует себя под рельеф окружающей среды. Медведь неимоверно силен. А собака Макс сочетает в себе достоинства разных представителей животного мира. Потому что выведена в секретной лаборатории. И так бы и закончила там дни своей жизни, если бы не вовремя поспевшая тележурналистка, сумевшая...
Они снова сражаются со злодеями из клана Футов и их главарем Шредером. Благодаря Эйприл О'Нил, профессору Джордану Пери и разносчику пиццы Кено черепашкам удается остановить распространение мутирующего вещества мутагена и спасти жителей Нью-Йорка от страшных мутантов Токка и Разара.